Here's how I understood, Qui est-ce qui= Who?

Qui est-ce-que= Whom?                                                                                                                                

Eg:

Qui est-ce qui fait la biologie? Who does Biology.                                      Qui est-ce qui ma prof? Who is my teacher?                                              Qui est-ce que vous avez vu? Whom did you see?                                      Qui est-ce qu'elle a vu? Whom did she see?                                          Qu'est-ce qui= What?                                                                         

In this case, what is the subject and performs the verb                              Qu'est-ce que=What?                                                                              In this case what is the object and the recipient of the verb.                      Eg:

Qu'est-ce qui fait ce bruit? What is making that noise?                              Qu'est-ce qui m'a fait peur? What scared me?                                            Qu'est-ce que tu as vu? What did you see?                                                Qu'est-ce que vouz avez pris? What did you take?